Archivos paleoecológicos de los sedimentos marinos de hace aproximadamente 125,000 años, un periodo que coincide con la aparición del homo sapiens moderno. En un ejemplo, los investigadores usaron núcleos del sedimento del estuario de lodo para construir una cronología que representa la disminución de la salud de los estuarios, especialmente el agotamiento de oxígeno. En un caso distinto, fósiles coralinos fueron usados para mostrar que las comunidades de coral en el caribe han cambiado poco en los últimos 125,000 años, antes de su deterioro en los 1980s según los resultados de la sobrepesca.

Archivos arqueológicos de las colonias costeras ocupadas hace aproximadamente 10,000 años. Estos archivos indican la explotación humana de los recursos costeros por poblaciones tan diversas como las sociedades aborígenes, ciudades grandes, y gigantes imperios. Los archivos incluyen artefactos de ruinas de cocinas antiguas y desechos que han ayudado a los científicos a localizar con precisión

la disminución de las tortugas del mar en la dieta humana. En un ejemplo, los investigadores estudiaron el tamaño de los huesos de pescado para investigar el deterioro histórico del bacalao Atlántico.

Archivos históricos de diarios y planos: del siglo XV al presente. Estos datos documentaron el periodo de expansión Europea basada en el comercio en las Américas y el sur del Pacífico. Un ejemplo es una pintura del año 1585 realizada por John White de los pescadores Algonquinos en Pamlico Sound, cerca de Cedar Island, North Carolina. La representación de White de la abundante vida marina, incluyendo los tiburónes martillo, y los esturiones, pone énfasis en la disminución de las poblaciones de especies rara vez observada en las aguas poco profundas de North Carolina.

Archivos ecológicos de literatura científicos durante el siglo pasado. Estos archivos, incluyendo literatura ecológica sobre el deterioro de las comunidades coralinas en el caribe y pastos marinos de la bahía de Florida, fueron comparados con archivos históricos antes del siglo XX.